More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1061 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  213  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  96.43 
 
 
112 aa  209  9e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  95.54 
 
 
112 aa  189  1e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  86.61 
 
 
112 aa  188  2e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 
112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 
112 aa  159  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 
112 aa  158  2e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 
112 aa  157  3e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  157  6e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
113 aa  154  3e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 
112 aa  140  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 
112 aa  140  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  123  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  123  9e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  122  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  122  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.93 
 
 
112 aa  122  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  120  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  56.25 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  118  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  118  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  57.41 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  58.88 
 
 
112 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  117  7e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
124 aa  117  7.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  116  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  116  9e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  116  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.49 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  58.25 
 
 
107 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
121 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
115 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
109 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  115  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  114  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>