More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1695 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  220  4e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.43 
 
 
110 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  123  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  51.38 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  56.73 
 
 
107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
113 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
112 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50 
 
 
112 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  117  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  117  6e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  53.57 
 
 
112 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  117  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  117  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 
109 aa  116  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
115 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.38 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 
110 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
113 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  114  3e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  114  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  52.29 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.11 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
115 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  114  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  6e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  50.89 
 
 
112 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  50.89 
 
 
112 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  114  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 
112 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 
112 aa  114  6e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
117 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
117 aa  114  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 
112 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
121 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  46.85 
 
 
113 aa  113  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  50 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>