More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0923 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0923  ammonium transporter  100 
 
 
441 aa  862    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1357  Rh family protein/ammonium transporter  69.7 
 
 
445 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.442305  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  68.39 
 
 
555 aa  567  1e-160  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  65.83 
 
 
562 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1360  Rh family protein/ammonium transporter  47.98 
 
 
471 aa  352  5.9999999999999994e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.11644  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0555  ammonium transporter  43.16 
 
 
446 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3791  ammonium transporter  40.79 
 
 
468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1796  ammonium transporter  40.14 
 
 
441 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3492  ammonium transporter  39.38 
 
 
461 aa  262  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1062  ammonium transporter  40.51 
 
 
408 aa  255  9e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.265606  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0499  ammonium transporter  37.92 
 
 
525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1612  ammonium transporter  40.05 
 
 
408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0885  ammonium transporter  40.05 
 
 
408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.373792  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3049  ammonium transporter  38.36 
 
 
460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1080  ammonium transporter  38.88 
 
 
408 aa  253  6e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0551  ammonium transporter  39.44 
 
 
444 aa  253  7e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.138976  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1609  ammonium transporter  39.95 
 
 
411 aa  253  7e-66  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1067  ammonium transporter  39.58 
 
 
411 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.796795  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3305  ammonium transporter  40.34 
 
 
408 aa  250  3e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.508137  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0880  ammonium transporter  39.35 
 
 
411 aa  250  4e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0728502  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0882  ammonium transporter  39.21 
 
 
411 aa  249  1e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.103537  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2528  ammonium transporter  39.91 
 
 
461 aa  248  2e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.26052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0113  ammonium transporter  37.9 
 
 
458 aa  247  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1229  ammonium transporter  37.05 
 
 
515 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1259  ammonium transporter  37.05 
 
 
515 aa  246  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1018  ammonium transporter  39.39 
 
 
445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00157851  normal  0.490999 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3175  ammonium transporter  37.36 
 
 
469 aa  244  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.640625  hitchhiker  0.0015046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1065  ammonium transporter  37.96 
 
 
411 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1482  ammonium transporter  40.52 
 
 
403 aa  241  2e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0782  ammonium transporter  36.32 
 
 
511 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0973  ammonium transporter  37.08 
 
 
441 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000814045  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28535  Amt family transporter: ammonium  37.73 
 
 
433 aa  238  1e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0442  ammonium transporter  39.29 
 
 
497 aa  237  3e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.757816 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1902  ammonium transporter  42.08 
 
 
478 aa  235  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0388203  hitchhiker  0.000364558 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02901  ammonium transporter  39.62 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0518  ammonium transporter  38.65 
 
 
435 aa  232  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000597851  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0532  ammonium transporter  38.65 
 
 
435 aa  232  1e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000756367  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4477  ammonium transporter  34.68 
 
 
488 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341446  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1629  ammonium transporter  37.95 
 
 
496 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03411  ammonium transporter  37.95 
 
 
496 aa  231  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1022  ammonium transporter  36.88 
 
 
449 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0624  Rh family protein/ammonium transporter  38.22 
 
 
416 aa  229  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0505999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2984  ammonium transporter  40.9 
 
 
478 aa  229  8e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24801  ammonium transporter  39.19 
 
 
482 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1138  ammonium transporter  40.53 
 
 
442 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2955  ammonium transporter  38.38 
 
 
518 aa  226  7e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02961  ammonium transporter  38.88 
 
 
486 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0144  ammonium transporter  39.13 
 
 
437 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0276  ammonium transporter  39.81 
 
 
489 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4312  ammonium transporter  35.24 
 
 
506 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2435  ammonium transporter  38.27 
 
 
471 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.127565  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0834  Rh family protein/ammonium transporter  38.22 
 
 
416 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1163  ammonium transporter  36.6 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000433758  normal  0.156813 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02861  ammonium transporter  38.88 
 
 
486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0486  ammonium transporter  37.88 
 
 
483 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02851  ammonium transporter  38.88 
 
 
486 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.64492  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3240  Rh family protein/ammonium transporter  36.36 
 
 
416 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.212447  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3831  ammonium transporter  37.56 
 
 
416 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0618394  normal  0.138544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3636  ammonium transporter  37.92 
 
 
509 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.348655 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4057  ammonium transporter  40.77 
 
 
435 aa  219  8.999999999999998e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.211238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0916  ammonium transporter  39.57 
 
 
462 aa  219  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.685309  normal  0.315253 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2630  ammonium transporter  38.28 
 
 
440 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1303  ammonium transporter  39.66 
 
 
447 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.863538  normal  0.392639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2589  ammonium transporter  37.78 
 
 
409 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  36.7 
 
 
584 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3707  ammonium transporter  37.08 
 
 
416 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00259002  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0247  ammonium transporter  39.25 
 
 
490 aa  216  5e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0798  ammonium transporter  37.08 
 
 
416 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0469975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3649  ammonium transporter  37.08 
 
 
416 aa  216  5e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243704  hitchhiker  0.000385246 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1341  ammonium transporter  38.37 
 
 
442 aa  216  8e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000498095  unclonable  0.00000143333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0651  Rh-like protein/ammonium transporter  36.08 
 
 
416 aa  216  8e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3120  ammonium transporter  35.1 
 
 
414 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3531  Rh family protein/ammonium transporter  36.23 
 
 
416 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1729  ammonium transporter  36.87 
 
 
507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.427726  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2218  ammonium transporter  36.95 
 
 
506 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0760  ammonium transporter  36.6 
 
 
408 aa  213  7e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3361  Rh family protein/ammonium transporter  36.6 
 
 
416 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0592  Rh family protein/ammonium transporter  36.6 
 
 
416 aa  213  7e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1530  ammonium transporter  35.09 
 
 
512 aa  212  9e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0265  ammonium transporter  38.08 
 
 
487 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0260  ammonium transporter  36.6 
 
 
416 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.647918  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3571  ammonium transporter  37.67 
 
 
446 aa  209  8e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0980  Rh family protein/ammonium transporter  37.02 
 
 
417 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.7151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3599  ammonium transporter  36.24 
 
 
417 aa  207  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1656  ammonium transporter  36.89 
 
 
507 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0646033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03436  hypothetical protein  35.99 
 
 
409 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0847  Rh family protein/ammonium transporter  35.58 
 
 
416 aa  207  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105757  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0934  Rh family protein/ammonium transporter  36.54 
 
 
416 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0642  putative ammonium transporter  34.3 
 
 
426 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2576  ammonium transporter  34.01 
 
 
433 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1757  ammonium transporter  37.05 
 
 
437 aa  205  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.966665 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002573  ammonium transporter  36.84 
 
 
381 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000132513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1479  ammonium transporter  35.19 
 
 
384 aa  205  1e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.946275  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3703  Rh-like protein/ammonium transporter  35.34 
 
 
400 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3162  Rh-like protein/ammonium transporter  36.62 
 
 
416 aa  203  4e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0234598  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2954  ammonium transporter  34.59 
 
 
488 aa  202  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1500  ammonium transporter  35.8 
 
 
414 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0565  ammonium transporter  34.56 
 
 
422 aa  202  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000904674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00480  putative ammonium transporter  38.08 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3025  ammonium transporter  37.2 
 
 
406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.228412  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>