More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2530 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 119 aa  236  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  77.59 
 
 		 116 aa  186  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0013  nitrogen regulatory protein P-II  75.65 
 
 		 116 aa  180  5.0000000000000004e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271001  normal  0.0615385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0900  nitrogen regulatory protein P-II  61.74 
 
 		 117 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  62.07 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 113 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 114 aa  106  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2893  nitrogen regulatory protein P-II  51.38 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0162783  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.21 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.11 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.32 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.64 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 114 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.43 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  45.54 
 
 		 114 aa  98.2  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.94 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.21 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>