More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1024 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 108 aa  213  5.9999999999999996e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  90.83 
 
 		 109 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  70.19 
 
 		 118 aa  147  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  62.96 
 
 		 108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 		 108 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  67.92 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  62.96 
 
 		 108 aa  140  5e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 		 117 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.26 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.09 
 
 		 117 aa  136  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  64.42 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  56.48 
 
 		 108 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  55.56 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 		 105 aa  110  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 105 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  49.07 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  45.95 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  38.98 
 
 		 121 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  37.74 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  40.62 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  36.07 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  34.23 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  36.11 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.18 
 
 		 114 aa  63.5  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  36.94 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  36.94 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.11 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  36.04 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  38.74 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  36.94 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  35.14 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  35.25 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  38.89 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  36.94 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  32.52 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  36.94 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.14 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  34.23 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>