More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0145 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
120 aa  236  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  57.85 
 
 
121 aa  149  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  52.46 
 
 
123 aa  137  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  51.24 
 
 
121 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  50.41 
 
 
121 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  51.2 
 
 
125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  49.59 
 
 
121 aa  130  6e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61 
 
 
114 aa  124  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  52.99 
 
 
125 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.88 
 
 
126 aa  103  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
126 aa  103  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
127 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  45.38 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.19 
 
 
131 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  45.67 
 
 
124 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  41.86 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  42.02 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.86 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.31 
 
 
125 aa  89  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  41.54 
 
 
125 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  42.02 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  39.53 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
113 aa  87.4  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  40.31 
 
 
125 aa  87  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  85.5  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  44.53 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
112 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.94 
 
 
112 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
112 aa  83.6  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
111 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.82 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  33.61 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
117 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3024  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  38.66 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  35.83 
 
 
123 aa  80.5  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
115 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  36.13 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  39.5 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  35.29 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.97 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>