More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0170 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
105 aa  213  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 
105 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 
105 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 
105 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
105 aa  121  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 
105 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
105 aa  113  6.9999999999999995e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  54.81 
 
 
116 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 
108 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
108 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
108 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
108 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  48.04 
 
 
106 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 
118 aa  107  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 
118 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 
118 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 
109 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 
108 aa  104  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  54.29 
 
 
105 aa  103  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  47.62 
 
 
118 aa  100  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.15 
 
 
118 aa  100  8e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.57 
 
 
117 aa  99.8  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 
118 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 
118 aa  99.4  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  45.71 
 
 
117 aa  98.2  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  41.53 
 
 
126 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  47.12 
 
 
110 aa  80.9  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  44.66 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.86 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  46.79 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  39.83 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  45.87 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  36.97 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.45 
 
 
110 aa  74.3  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.12 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  44.95 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  43.93 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  44.04 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 
112 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 
112 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  44.86 
 
 
114 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  43.93 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>