More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2820 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 109 aa  215  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  90.83 
 
 		 108 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  66.36 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 		 116 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  69.52 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  62.39 
 
 		 108 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  63.3 
 
 		 108 aa  140  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 108 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  65.42 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  57.8 
 
 		 108 aa  131  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  61.68 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.81 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.68 
 
 		 117 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  60.95 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 105 aa  117  6e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  55.96 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  51.38 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  48.62 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 		 126 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 110 aa  75.9  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  41.59 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  36.52 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  38.32 
 
 		 107 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 		 112 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  67  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  38.21 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  40.35 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  37.62 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.82 
 
 		 114 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.61 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  35.78 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  34.15 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  34.23 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  35.14 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  36.61 
 
 		 562 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  36.7 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  33.03 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  35.78 
 
 		 555 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  33.93 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  36.61 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.71 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  58.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  33.93 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  35.4 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>