More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0560 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
108 aa  212  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 
108 aa  171  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  62.96 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  62.39 
 
 
109 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  60.19 
 
 
108 aa  136  7.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  61.54 
 
 
118 aa  133  9e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  60.58 
 
 
116 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  57.55 
 
 
118 aa  131  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  60.58 
 
 
118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.55 
 
 
118 aa  128  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  52.88 
 
 
108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  54.81 
 
 
118 aa  123  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 
118 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  55.77 
 
 
118 aa  121  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
105 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
105 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.77 
 
 
117 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 
105 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 
105 aa  114  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
106 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
105 aa  110  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 
105 aa  110  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
105 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  44.44 
 
 
105 aa  86.3  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  44.35 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  44.14 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  37.74 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  41 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
109 aa  72  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
121 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.54 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  35.59 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  41.41 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  44.14 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  40.54 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
111 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
121 aa  68.2  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.74 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  43.24 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  43.24 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  41.67 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.74 
 
 
110 aa  67  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 
112 aa  67  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.6  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
115 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  40.18 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
136 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  42.34 
 
 
113 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>