More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0085 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
112 aa  219  8e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  58.88 
 
 
112 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  62.26 
 
 
109 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 
107 aa  130  6e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.94 
 
 
110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  58.49 
 
 
112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 
112 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 
112 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  53.85 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 
113 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
110 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  107  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  103  5e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  101  4e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  100  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  100  9e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  50.46 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
111 aa  99  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 
112 aa  98.6  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 
115 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.27 
 
 
112 aa  97.1  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  96.7  9e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  96.3  1e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  96.7  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  95.5  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
110 aa  95.9  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  47.17 
 
 
112 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
115 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.17 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  49.06 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.3 
 
 
112 aa  93.6  7e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  93.2  9e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  93.6  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  93.2  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.15 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  92.8  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.11 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  49.5 
 
 
124 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.11 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0033  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 
112 aa  92.8  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  92  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>