More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0100 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
121 aa  244  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  96.69 
 
 
121 aa  240  6e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  94.21 
 
 
121 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  74.38 
 
 
121 aa  194  3e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  51.24 
 
 
120 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  52 
 
 
125 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  46.72 
 
 
123 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.53 
 
 
114 aa  118  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
127 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
128 aa  105  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
125 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.53 
 
 
131 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  47.58 
 
 
125 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.77 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  40.65 
 
 
130 aa  92  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 
126 aa  92  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  43.55 
 
 
125 aa  90.9  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 
125 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.35 
 
 
125 aa  90.1  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  41.09 
 
 
125 aa  87  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  42.28 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  41.73 
 
 
124 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  36.59 
 
 
112 aa  84  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.32 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.4 
 
 
112 aa  84.3  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  42.75 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  82  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  38.41 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  40.16 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 
105 aa  77.8  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  31.72 
 
 
146 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
106 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  34.71 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.19 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  36.89 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.89 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  38.84 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 
110 aa  74.7  0.0000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  39.67 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  37.7 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  33.06 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  33.06 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  33.61 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
115 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  38.52 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.07 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  38.02 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  33.61 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  35.54 
 
 
113 aa  73.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
111 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  35.25 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  33.88 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  36.07 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
108 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2623  Rh family protein/ammonium transporter  35.48 
 
 
562 aa  72.8  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.432084 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  33.61 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  35.59 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>