More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1432 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
128 aa  259  8e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  46.51 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  47.62 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  49.21 
 
 
125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
121 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  43.51 
 
 
121 aa  104  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
121 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.04 
 
 
114 aa  102  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
125 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  40 
 
 
123 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
127 aa  98.6  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  44.36 
 
 
131 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
130 aa  97.1  7e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 
124 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 
112 aa  89  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  43.31 
 
 
126 aa  88.6  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  40.6 
 
 
126 aa  88.2  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  87.8  5e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 
112 aa  87  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 
115 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  36.23 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  83.6  9e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.15 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  41.41 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.15 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.51 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  37.12 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.68 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  34.38 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  38.64 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  37.3 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  40.8 
 
 
123 aa  79  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
117 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  35.94 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  35.86 
 
 
146 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  37.88 
 
 
125 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  40.62 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  41.94 
 
 
125 aa  77.4  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  41.27 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  39.68 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  39.34 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  38.1 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>