More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1048 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
127 aa  258  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  42.64 
 
 
123 aa  110  9e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  42.42 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
121 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
121 aa  107  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  47.24 
 
 
121 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  45.24 
 
 
125 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  44.88 
 
 
120 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  46.46 
 
 
121 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
128 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  42.19 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  41.41 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  39.85 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.92 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.15 
 
 
114 aa  92  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  42.65 
 
 
131 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  90.5  8e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 
125 aa  89  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  42.64 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.85 
 
 
125 aa  87.4  7e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  39.06 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.11 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  86.7  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
112 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  37.69 
 
 
126 aa  84  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  43.08 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  39.53 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  42.54 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  38.33 
 
 
109 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  39.2 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0550  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
106 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  38.93 
 
 
125 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  32.88 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  36.97 
 
 
105 aa  77  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  76.6  0.00000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  38.1 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  33.05 
 
 
107 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  32.54 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  37.7 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  38.89 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  38.89 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  37.88 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.92 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  36.22 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  36.22 
 
 
113 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  37.3 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  34.13 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  34.92 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  33.33 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  36.51 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  34.13 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  34.92 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>