More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1157 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
108 aa  215  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  71.15 
 
 
116 aa  158  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  69.23 
 
 
118 aa  156  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  68.27 
 
 
118 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  64.42 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  64.76 
 
 
118 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  63.3 
 
 
109 aa  140  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  62.96 
 
 
108 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  62.86 
 
 
117 aa  138  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  60.19 
 
 
108 aa  136  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  62.86 
 
 
118 aa  135  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 
118 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.42 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.58 
 
 
118 aa  134  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  61.54 
 
 
118 aa  133  9e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 
108 aa  131  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
105 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
105 aa  117  7e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  57.69 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 
105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 
106 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
105 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 
105 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 
105 aa  103  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  49.07 
 
 
105 aa  94.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
110 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  43.24 
 
 
109 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
111 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 
107 aa  77.4  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  48.18 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  44.95 
 
 
112 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 
120 aa  72  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.94 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
112 aa  71.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 
112 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  37.82 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  69.7  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.2 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  34.26 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
113 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  37.96 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.18 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  33.63 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  39.45 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>