More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1640 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 
110 aa  225  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 
112 aa  97.1  7e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  43.24 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 
112 aa  93.6  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 
112 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
112 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 
112 aa  90.1  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 
112 aa  89.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  45.13 
 
 
113 aa  90.1  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  40.35 
 
 
112 aa  87  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  41.44 
 
 
112 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
115 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  39.47 
 
 
112 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  41.88 
 
 
112 aa  84  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  36.7 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 
112 aa  83.6  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  38.6 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.81 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  36.7 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  38.6 
 
 
117 aa  82  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.64 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.32 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
111 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  35.9 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  39.22 
 
 
105 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  36.44 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  38.18 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  38.6 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.61 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  38.18 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.53 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  39.62 
 
 
105 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  37.93 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  40.35 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  38.53 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  39.32 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4574  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  37.07 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  38.14 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  39.32 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  35.04 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  35.85 
 
 
109 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  33.04 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1698  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 
113 aa  77.8  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  36.7 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.61 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0532  nitrogen regulatory protein P-II  35.59 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  37.07 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.46 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  36.52 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>