More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0532 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0532  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  217  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1698  nitrogen regulatory protein P-II  66.37 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  57.52 
 
 		 112 aa  122  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  120  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  56.64 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 113 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3635  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.284455 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.44 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.1 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1020  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.852949  normal  0.847893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1830  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.579927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.33 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2268  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0865  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.445753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  51.33 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 117 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 114 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1499  ammonium transporter  48.67 
 
 		 584 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907074  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  48.67 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  54.13 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  54.13 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  52.21 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50.44 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  46.02 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  48.67 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2273  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.201182  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2217  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.02 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  46.02 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>