More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1698 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1698  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  222  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0532  nitrogen regulatory protein P-II  66.37 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  56.64 
 
 		 112 aa  123  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  58.41 
 
 		 112 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1300  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00561712  normal  0.201127 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  56.64 
 
 		 112 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.1 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  115  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  49.56 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  53.98 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  54.87 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.33 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.56 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  52.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.21 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  53.1 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  50.44 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  46.02 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  49.56 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  47.79 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  48.67 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  48.67 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  46.9 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  47.79 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  51.33 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50.44 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>