More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0659 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  98.1 
 
 
105 aa  208  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  97.14 
 
 
105 aa  207  5e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  84.76 
 
 
105 aa  185  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  66 
 
 
105 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  56 
 
 
106 aa  130  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 
105 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  60 
 
 
105 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 
105 aa  120  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
108 aa  117  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 
109 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
108 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
116 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
108 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  50.49 
 
 
118 aa  106  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
118 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  49.51 
 
 
118 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.49 
 
 
118 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  48.54 
 
 
118 aa  101  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  47.57 
 
 
117 aa  100  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.51 
 
 
117 aa  98.6  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  41.53 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 
112 aa  84.7  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 
113 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
110 aa  83.6  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.38 
 
 
110 aa  81.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.91 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.19 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.28 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  45.19 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 
111 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  43.14 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  44.55 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  45.19 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 
114 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.62 
 
 
110 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.74 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.91 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.57 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  41.12 
 
 
110 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  41.18 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>