More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2067 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 111 aa  220  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 113 aa  108  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  108  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  52.29 
 
 		 112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  52.29 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  51.38 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  51.38 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  103  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  51.85 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  47.75 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  48.18 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  49.54 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  50.94 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1489  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.22 
 
 		 113 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.07 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.07 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.07 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  46.3 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.22 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  46.3 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  48.15 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.62 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  48.15 
 
 		 114 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>