More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2280 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 105 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 105 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  56.19 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 		 105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 		 105 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 		 106 aa  124  6e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  61.9 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 105 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 		 105 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 		 108 aa  110  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 108 aa  110  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  54.72 
 
 		 118 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 109 aa  107  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.92 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 108 aa  103  8e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.89 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 108 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 118 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  47.12 
 
 		 118 aa  98.2  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  50.96 
 
 		 108 aa  98.2  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 116 aa  95.1  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.51 
 
 		 110 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 		 107 aa  76.6  0.00000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 113 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  40.57 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  35.29 
 
 		 123 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0531  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00497558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0517  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 113 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000164694  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 113 aa  72  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  36.21 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  41.67 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.74 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.81 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  40.19 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 		 112 aa  70.9  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  38.32 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  40.19 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  40.19 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  40.19 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  40.19 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 		 116 aa  70.1  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  38.32 
 
 		 112 aa  70.1  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>