More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2614 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
116 aa  227  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  82.24 
 
 
118 aa  176  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  75.7 
 
 
118 aa  171  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  69.16 
 
 
108 aa  160  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  71.15 
 
 
108 aa  158  2e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  66.98 
 
 
108 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  67.29 
 
 
109 aa  145  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  58.26 
 
 
118 aa  143  8.000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.91 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.63 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  56.36 
 
 
117 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  59.81 
 
 
118 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  58.26 
 
 
118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  54.78 
 
 
118 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  62.75 
 
 
108 aa  133  8e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  60.58 
 
 
108 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  54.21 
 
 
106 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  54.81 
 
 
105 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 
105 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
105 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 
105 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 
105 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
105 aa  108  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
105 aa  95.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  46.6 
 
 
105 aa  90.1  9e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  46 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 
111 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.74 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 
112 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  34.82 
 
 
121 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  40.57 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
109 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  34.82 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  33.93 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  66.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  40.87 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0525  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.291084  normal  0.274435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  65.5  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  41 
 
 
112 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  41.59 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  65.1  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
113 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  38.14 
 
 
123 aa  64.7  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  35.78 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1455  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
108 aa  64.3  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.935192 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0187  ammonium transporter  42.45 
 
 
555 aa  63.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 
113 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0833  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.81 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.81 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 
114 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  34.26 
 
 
112 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  39.81 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  35.96 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2577  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1356  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.737714  normal  0.542504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  37.29 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2274  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  62.8  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.468205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  37.38 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  39.82 
 
 
112 aa  63.5  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0186  nitrogen regulatory protein P-II  41.51 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  37.74 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  40.71 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  34.51 
 
 
112 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  37.74 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>