More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2505 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 110 aa  213  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 109 aa  142  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  63.55 
 
 		 107 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  59.43 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  57.94 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  55.14 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 		 112 aa  120  5e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  53.64 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.72 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  52.83 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  52.73 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  53.64 
 
 		 112 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  57.27 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  54.13 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  52.73 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  51.82 
 
 		 112 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0380  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 114 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  55.14 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  50.91 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  113  8.999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 113 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  54.72 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  54.72 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  52.34 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  54.72 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  54.72 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.72 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  58.49 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  50 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.94 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  55.66 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  110  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  110  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  52.73 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>