More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0684 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  88.14 
 
 		 118 aa  204  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  85.59 
 
 		 118 aa  202  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  83.9 
 
 		 118 aa  196  7e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80 
 
 		 117 aa  190  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  78.81 
 
 		 118 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  77.97 
 
 		 118 aa  176  7e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 		 108 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  60.75 
 
 		 118 aa  145  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  63.46 
 
 		 118 aa  140  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  56.36 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  62.86 
 
 		 108 aa  138  3e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  63.21 
 
 		 108 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  61.68 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 108 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 108 aa  119  9e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  49.51 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 		 105 aa  103  8e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  48.54 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  47.57 
 
 		 105 aa  100  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  47.57 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  45.71 
 
 		 105 aa  98.2  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  45.63 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  35.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  35.04 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 112 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 111 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  35.65 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 		 112 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  33.9 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  41.28 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  66.6  0.00000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1710  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.619022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  35.14 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  38.18 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  37.27 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  33.06 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  36.84 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  38.53 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  34.78 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  34.78 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  39.09 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  36.52 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  38.53 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  35.45 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  31.4 
 
 		 123 aa  63.5  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  38.18 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  33.91 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  36.36 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  36.52 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  34.78 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  37.61 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>