More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3176 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
115 aa  231  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  133  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  58.04 
 
 
112 aa  130  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  56.25 
 
 
112 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  130  9e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  130  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  58.33 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  55.75 
 
 
114 aa  127  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  126  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0993  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.469718  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0470  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.933186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  54.55 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18621  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.436109  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
113 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  5e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  123  6e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.36 
 
 
112 aa  124  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  124  6e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  124  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  123  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 
112 aa  123  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  123  7e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  123  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50.93 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  123  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  123  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  122  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  122  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  122  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3162  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000317831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  55.75 
 
 
114 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  121  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  54.46 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>