More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0064 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
105 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  84.76 
 
 
105 aa  185  2e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  82.86 
 
 
105 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  81.9 
 
 
105 aa  181  3e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  63 
 
 
105 aa  143  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  55 
 
 
106 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  55.24 
 
 
105 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 
105 aa  125  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  58.1 
 
 
105 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 
108 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  52.38 
 
 
105 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 
109 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 
108 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 
118 aa  115  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  52.78 
 
 
108 aa  114  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  51.46 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  54.37 
 
 
118 aa  111  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.46 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 
118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 
118 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  49.51 
 
 
117 aa  105  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.4 
 
 
117 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 
112 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.64 
 
 
126 aa  86.7  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  42.31 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  44.44 
 
 
112 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  41.53 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  46.15 
 
 
112 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  43.14 
 
 
107 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  40.68 
 
 
121 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  43.52 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  40.34 
 
 
121 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
109 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  42.37 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  44.55 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
113 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.74 
 
 
112 aa  78.6  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  43.27 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  39.66 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  35.65 
 
 
120 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  43.27 
 
 
115 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1640  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.74 
 
 
110 aa  77  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0931599  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0535  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.862909  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  36.44 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  41.35 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  40.38 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0831  nitrogen regulatory protein P-II, putative  43.12 
 
 
113 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0317945  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40.57 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 
112 aa  75.9  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 
112 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>