More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1245 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  100 
 
 		 117 aa  232  1.0000000000000001e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  80 
 
 		 117 aa  190  4e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  80.17 
 
 		 118 aa  190  5e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  82.76 
 
 		 118 aa  189  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  79.31 
 
 		 118 aa  184  4e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  78.18 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  79.09 
 
 		 118 aa  173  6e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  66.67 
 
 		 108 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  64.49 
 
 		 118 aa  147  6e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  59.63 
 
 		 116 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  64.42 
 
 		 118 aa  138  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  65.09 
 
 		 108 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  64.42 
 
 		 108 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  61.68 
 
 		 109 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 108 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  53.7 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 105 aa  107  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.4 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  53.27 
 
 		 105 aa  103  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 105 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  49.51 
 
 		 105 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  48.57 
 
 		 105 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  48.54 
 
 		 105 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  49.51 
 
 		 105 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  47.57 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.17 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  45.22 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 		 112 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  37.19 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  68.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.74 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  43.12 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  67  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  41.74 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  35.83 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2530  nitrogen regulatory protein P-II  38.46 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.18925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  35.9 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  41.74 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  37.39 
 
 		 115 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  41.82 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  40 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  40 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  38.94 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  35.54 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.26 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  38.26 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  42.61 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  40.91 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.45 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  41.74 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  40.87 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  39.13 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0922  nitrogen regulatory protein P-II  40.54 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.524146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  39.13 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  38.26 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  42.2 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>