More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0835 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  82.24 
 
 		 116 aa  176  8e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  70.64 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  63.89 
 
 		 108 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  70.19 
 
 		 108 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  68.27 
 
 		 108 aa  146  9e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.02 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  69.52 
 
 		 109 aa  144  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  63.46 
 
 		 118 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  63.46 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 118 aa  141  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.53 
 
 		 117 aa  140  4e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  59.65 
 
 		 118 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  58.18 
 
 		 118 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  60.58 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  57.69 
 
 		 108 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 105 aa  108  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 		 106 aa  107  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  52.43 
 
 		 105 aa  107  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 105 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 105 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 		 105 aa  101  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 		 105 aa  100  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  46.6 
 
 		 105 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  45.83 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  45.83 
 
 		 110 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 121 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 		 111 aa  68.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  39.81 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  66.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1361  nitrogen regulatory protein P-II  43.93 
 
 		 121 aa  65.5  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.212904  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  38.05 
 
 		 112 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  36.11 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  38.68 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  36.13 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0933  nitrogen regulatory protein P-II  38.39 
 
 		 112 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  37.84 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0979  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.594986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  62  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  36.28 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  36.11 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.28 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  36.21 
 
 		 125 aa  60.1  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.61 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  60.1  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  60.5  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  35.71 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  36.61 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  36.04 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  37.14 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2036  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.504448  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  36.61 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  37.17 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  34.45 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  36.11 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.81 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  39.29 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  37.96 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  38.74 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  33.96 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  38.89 
 
 		 112 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>