More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0158 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 110 aa  221  2e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  59.26 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  117  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.13 
 
 		 110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  54.9 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 109 aa  105  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  103  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  47.12 
 
 		 113 aa  99  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.34 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.17 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2536  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.94 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.679414  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  48.11 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 110 aa  94.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0642  nitrogen regulatory protein  48.11 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0626  nitrogen regulatory protein  48.11 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  47.17 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 136 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.55 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 114 aa  93.2  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>