More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0297 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 109 aa  214  2e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  61.32 
 
 		 107 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 109 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  55.14 
 
 		 110 aa  125  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 		 112 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  53.85 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  49.52 
 
 		 113 aa  107  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1356  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.51478  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1359  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.202328  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 110 aa  105  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0566  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000025386  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  103  7e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  103  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.54 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  53.77 
 
 		 112 aa  102  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  47.71 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  46.23 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.54 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  99  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  48.11 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.06 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2374  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.353669 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  47.62 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2863  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00920081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  47.17 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.89 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  46.23 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  96.7  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>