More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0981 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  224  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  182  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  176  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  76.58 
 
 		 113 aa  175  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  80.18 
 
 		 113 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  69.64 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  64.29 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 117 aa  149  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3058  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  137  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  56.25 
 
 		 112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 117 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  137  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  137  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 113 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0800  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2229  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  135  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000520156  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.14 
 
 		 112 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  56.25 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 		 112 aa  134  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2171  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0143808  normal  0.0847561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50.89 
 
 		 112 aa  134  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>