More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3426 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  216  8.999999999999998e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  84.82 
 
 		 112 aa  190  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  82.14 
 
 		 112 aa  185  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  172  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  73.21 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  166  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  75 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  70.54 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 113 aa  164  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 117 aa  156  7e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  75.89 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  74.77 
 
 		 113 aa  151  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  72.97 
 
 		 113 aa  150  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 136 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  62.62 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  64.15 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0428  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  146  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  146  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 114 aa  145  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  62.5 
 
 		 112 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>