More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1466 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 113 aa  220  6e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  87.39 
 
 		 112 aa  189  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  83.78 
 
 		 112 aa  184  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  87.61 
 
 		 113 aa  184  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  76.58 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  164  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 112 aa  161  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  69.37 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  72.97 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  78.38 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  69.37 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  64.86 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  67.57 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  73.87 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 112 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 117 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  60.36 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  143  6e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  143  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  58.56 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  69.03 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  63.06 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  59.46 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  59.46 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  59.46 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  61.26 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  70.27 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  57.52 
 
 		 136 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 114 aa  140  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  54.95 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  65.77 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  57.66 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  59.46 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  54.95 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0148  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  56.76 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  58.56 
 
 		 112 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 		 112 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>