More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4014 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  171  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  169  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  74.11 
 
 		 112 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  167  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 114 aa  151  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1609  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0701644  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 121 aa  151  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  61.61 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  62.5 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  64.86 
 
 		 113 aa  150  7e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 136 aa  150  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0047  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000287221  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 113 aa  149  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 136 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  61.61 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  63.39 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  59.82 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  59.29 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1737  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0595912  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  60.71 
 
 		 112 aa  147  3e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 117 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>