More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3268 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  168  2e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  166  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  62.5 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  65.77 
 
 		 113 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  66.07 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  60.71 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3251  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.534488  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3220  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2865  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3039  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.437205 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3057  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1060  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3078  nitrogen regulatory protein P-II 2  58.93 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00402  nitrogen assimilation regulatory protein for GlnL, GlnE, and AmtB  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3159  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0539  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.843641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0527  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0918  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3165  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0486  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0494  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00406  hypothetical protein  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0377  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  147  7e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0522  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0506  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  60.71 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0503  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0597213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 114 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0565  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.941752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0512  nitrogen regulatory protein P-II 2  57.14 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  144  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  69.37 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  144  5e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  144  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02445  regulatory protein P-II for glutamine synthetase  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1115  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2937  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2762  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1124  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2838  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02409  hypothetical protein  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2803  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3787  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2720  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  143  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  56.25 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.93 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  142  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  141  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  60.71 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  141  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  140  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  60.75 
 
 		 117 aa  140  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 		 112 aa  140  9e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  58.04 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>