More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2171 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2171  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  217  3.9999999999999997e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0143808  normal  0.0847561 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  166  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  163  6.9999999999999995e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  160  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4239  nitrogen regulatory protein PII  67.86 
 
 		 116 aa  157  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 136 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  66.07 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  68.75 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  63.39 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 114 aa  154  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.96 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0156  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3243  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.669306  normal  0.422234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  67.86 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0449  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321853  normal  0.279949 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0271  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591612  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0372  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  64.29 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>