More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0693 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  223  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  77.68 
 
 		 112 aa  184  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  184  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  168  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  160  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0555  nitrogen regulatory protein P-II  71.43 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 136 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 136 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  66.96 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  63.39 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03655  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.949365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03437  hypothetical protein  66.07 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3627  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3038  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.196983  normal  0.293626 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1109  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0216976  hitchhiker  0.00000214142 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3237  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  62.5 
 
 		 112 aa  147  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2706  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2824  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2918  nitrogen regulatory protein P-II 1  64.29 
 
 		 112 aa  147  5e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.94675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>