More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2326 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2326  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  222  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.875617  normal  0.385523 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1918  nitrogen regulatory protein P-II  80.36 
 
 		 112 aa  187  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0693  nitrogen regulatory protein P-II  76.79 
 
 		 112 aa  184  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.333555  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1130  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  167  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0143  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2629  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.594654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4056  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.559435 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2547  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.620623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0889  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0119  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 112 aa  157  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  68.75 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0995  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.882952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  155  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2171  nitrogen regulatory protein P-II  72.32 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0143808  normal  0.0847561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  67.86 
 
 		 112 aa  153  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  152  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  67.86 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0275  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1663  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  4e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.824699  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  151  4e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  66.07 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1302  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.54202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 121 aa  150  7e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  65.18 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2477  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.698113  normal  0.567778 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03655  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.949365  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  150  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3631  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1155  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.717243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1262  nitrogen regulatory protein P-II 1  66.96 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.297918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  149  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>