More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0850 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0850  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  226  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2491  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  157  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0578365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2231  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 
112 aa  156  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000261063 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 
112 aa  142  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 
112 aa  141  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 
112 aa  137  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 
113 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3148  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000232085  hitchhiker  0.0073566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1394  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00884752  decreased coverage  0.00366325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  133  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  133  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 
112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  131  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  54.46 
 
 
112 aa  131  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
117 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1163  nitrogen regulatory protein P-II  56.76 
 
 
113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334919  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  56.25 
 
 
112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  128  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.89 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  55.86 
 
 
113 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  53.57 
 
 
112 aa  127  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  50 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  54.46 
 
 
112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  50 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  124  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  124  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0594  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  124  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  52.68 
 
 
112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  50 
 
 
112 aa  124  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1657  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  124  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1545  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1730  nitrogen regulatory protein P-II  52.68 
 
 
112 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434906  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0259  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6203  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  124  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6030  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2480  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  123  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.312055  normal  0.888078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69810  nitrogen regulatory protein P-II 2  49.11 
 
 
112 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.241854 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  123  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  123  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  123  7e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1217  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.967639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  123  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  123  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  47.32 
 
 
112 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  122  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0085  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  51.79 
 
 
112 aa  122  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.308979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  51.79 
 
 
112 aa  122  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  122  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50.89 
 
 
112 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  122  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 
112 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  47.32 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
112 aa  121  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  49.11 
 
 
116 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3426  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 
112 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000243696  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3268  nitrogen regulatory protein P-II  55.36 
 
 
112 aa  121  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0681608  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 
112 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>