More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6203 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6203  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.296271  normal  0.0483191 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0421  nitrogen regulatory protein P-II  89.19 
 
 		 113 aa  178  2e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.666216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  74.11 
 
 		 112 aa  178  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  74.11 
 
 		 112 aa  174  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  73.21 
 
 		 112 aa  174  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  165  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4014  nitrogen regulatory protein P-II  70.54 
 
 		 112 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00726508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1786  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  162  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  161  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  69.64 
 
 		 112 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  68.75 
 
 		 117 aa  157  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  66.07 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  157  4e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 136 aa  157  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2209  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  157  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.538315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  157  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  156  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2530  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2915  nitrogen regulatory protein P-II 2  63.39 
 
 		 112 aa  156  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0326538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2406  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  62.5 
 
 		 112 aa  156  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1879  nitrogen regulatory protein P-II  65.18 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000257329  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3832  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00851971  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3650  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.107893  hitchhiker  0.000239042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3708  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00803334  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0797  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.131267  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0552  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.524059  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  66.07 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47790  Nitrogen regulatory protein P-II GlnK  61.61 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.144153  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0761  nitrogen regulatory protein P-II 1  59.82 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4832  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  63.39 
 
 		 112 aa  154  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  68.47 
 
 		 113 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3241  nitrogen regulatory protein P-II  60.71 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2357  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  64.29 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  154  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  60.71 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2546  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  154  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.164416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  58.93 
 
 		 112 aa  153  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  58.04 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0564  nitrogen regulatory protein P-II  63.39 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000717962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  153  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  66.96 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  59.82 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0277  nitrogen regulatory protein P-II  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  62.5 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  61.61 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>