More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0742 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  219  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  56.07 
 
 		 109 aa  124  5e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 110 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  50.98 
 
 		 107 aa  115  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 		 112 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.28 
 
 		 110 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  49.04 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1066  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  104  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.775357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2525  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.720129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1565  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.204869  normal  0.0818079 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 113 aa  101  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 		 112 aa  101  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1299  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1480  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1235  Nitrogen regulatory protein PII  42.45 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  48.21 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1481  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  48.08 
 
 		 112 aa  100  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  100  6e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0886  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.812939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0881  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24631  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  47.32 
 
 		 112 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  44.23 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  46.36 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  49.52 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  99.4  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0034  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  45.19 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  43.75 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  97.4  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  45.54 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  43.64 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  42.06 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  97.1  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  45.54 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5234  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0217  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.531374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0190  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0053  nitrogen regulatory protein P-II  45.19 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0041295  normal  0.377674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5143  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5506  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.851812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0238  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0928138  normal  0.898368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 		 112 aa  95.9  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  41.96 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5295  nitrogen regulatory protein P-II  41.07 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  44.64 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1304  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.774193  normal  0.209326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  46.43 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  42.73 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  43.75 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>