More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0435 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 112 aa  223  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0085  nitrogen regulatory protein P-II  58.88 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  55.66 
 
 		 109 aa  124  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.27 
 
 		 110 aa  121  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0742  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  104  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0297  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  100  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 		 112 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 		 110 aa  99.4  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0883  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.386299  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1064  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1079  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.908178  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 		 112 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 112 aa  98.6  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  44.86 
 
 		 112 aa  98.2  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  97.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1089  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 		 112 aa  98.2  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.101953  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  47.12 
 
 		 113 aa  98.2  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1123  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.727128  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 		 112 aa  97.1  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0086  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.11 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0840353  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1611  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0884  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 		 112 aa  96.7  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.275382  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3772  nitrogen regulatory protein P-II  47.22 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762526 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12933  nitrogen regulatory protein P-II glnB  47.17 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.30403e-36  normal  0.258229 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2852  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287324  normal  0.0455746 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  43.4 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  45.87 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23790  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  95.5  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.411454  normal  0.269755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  95.9  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0181  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.153981  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  44.34 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2003  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0914763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1937  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  46.23 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0233  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0163  nitrogen regulatory protein P-II  47.71 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.814781 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1957  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.158303  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00479  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  45.19 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  94.4  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0491  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0981  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  45.87 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94.7  4e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 		 112 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0939  nitrogen regulatory protein P-II, putative  47.17 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 		 112 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  93.6  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  46.23 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1610  nitrogen regulatory protein P-II  44.34 
 
 		 112 aa  94  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1021  nitrogen regulatory protein PII  42.45 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.11 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002572  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000156099  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1388  nitrogen regulatory protein P-II  45.28 
 
 		 112 aa  93.6  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.258506  normal  0.939142 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  45.37 
 
 		 136 aa  93.6  9e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4461  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.188449  normal  0.905473 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3362  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0591  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3532  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  93.6  9e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.23 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2905  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 		 112 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>