More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0934 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0934  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
110 aa  216  1e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 
112 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  57.27 
 
 
110 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  54.72 
 
 
112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  56.6 
 
 
109 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1685  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
107 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.483809  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
112 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50.47 
 
 
112 aa  105  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
114 aa  105  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  104  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  104  4e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50.47 
 
 
112 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0146  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220304  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1779  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  103  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.903734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  103  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2206  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.642209  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0969  nitrogen regulatory protein P-II  46.23 
 
 
112 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.916041  hitchhiker  0.000334887 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1090  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0742  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0306564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  51.4 
 
 
112 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1243  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.50478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1085  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.260987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0883  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1584  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.138814  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3013  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00180505  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2271  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2842  nitrogen regulatory protein P-II  49.09 
 
 
112 aa  103  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.723657 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1680  nitrogen regulatory protein P-II  49.53 
 
 
112 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892392  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15821  nitrogen regulatory protein P-II  50.47 
 
 
112 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 
112 aa  102  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1118  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3176  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
115 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00223348 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0137  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  101  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000150493  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0879  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0240  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  101  4e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2415  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.194654  hitchhiker  0.00652052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5738  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14101  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1799  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.534869  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  101  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2456  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00114582  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2411  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2321  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0286658  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1074  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  49.06 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0912  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.66 
 
 
112 aa  100  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  4.42242e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2735  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.120563  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 
112 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
136 aa  100  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  49.06 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0321  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 
112 aa  100  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1874  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1848  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0456  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  100  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2604  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  48.11 
 
 
112 aa  100  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1227  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  100  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  100  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  100  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  45.45 
 
 
112 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3048  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  47.17 
 
 
112 aa  100  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  47.71 
 
 
112 aa  100  9e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03014  GlnB  47.17 
 
 
112 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000337232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  46.73 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1760  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.654192  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1183  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000414961 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  46.73 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3395  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  50 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  48.6 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3078  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000004264  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0435  nitrogen regulatory protein P-II  47.66 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.17538  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  45.79 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>