More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1047 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1047  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 		 105 aa  210  7e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2280  nitrogen regulatory protein P-II  59.05 
 
 		 105 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000332901  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0064  nitrogen regulatory protein P-II  53.33 
 
 		 105 aa  125  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1024  nitrogen regulatory protein P-II  54.63 
 
 		 108 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0170  nitrogen regulatory protein P-II  57.14 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.01556  normal  0.599524 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0659  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 105 aa  120  5e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769311  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0144  nitrogen regulatory protein P-II  54.29 
 
 		 105 aa  120  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.419714  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1802  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0099  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.477301  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1529  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  53.77 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0743  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 118 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0684  nitrogen regulatory protein P-II  51.89 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2820  nitrogen regulatory protein P-II  53.21 
 
 		 109 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.777826  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3091  nitrogen regulatory protein P-II  50.94 
 
 		 108 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0560  nitrogen regulatory protein P-II  51.85 
 
 		 108 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000121582  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1752  nitrogen regulatory protein P-II  51.92 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.435778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1143  nitrogen regulatory protein P-II  49.07 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.903165  normal  0.919157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2614  nitrogen regulatory protein P-II  52.83 
 
 		 116 aa  110  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1950  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 118 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0120219  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1628  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000194197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0835  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 118 aa  108  3e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1245  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.06 
 
 		 117 aa  107  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1157  nitrogen regulatory protein P-II  51.43 
 
 		 108 aa  107  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1018  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 		 118 aa  107  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.466581  normal  0.730099 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1433  nitrogen regulatory protein P-II  45.63 
 
 		 106 aa  105  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1555  P-II family nitrogen regulatory protein  51.43 
 
 		 105 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0437  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.527989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  44.76 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2067  nitrogen regulatory protein P-II  44.04 
 
 		 111 aa  82.8  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00356082  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1081  nitrogen regulatory protein P-II  46.3 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.630739  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  44.76 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  43.81 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1110  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000614062  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  39.81 
 
 		 112 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1095  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1206  nitrogen regulatory protein P-II  40.95 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0104  nitrogen regulatory protein P-II  41.67 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3917  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  77.4  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1960  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1762  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 112 aa  77  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1903  nitrogen regulatory protein P-II  41.28 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.88445  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1494  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  41.9 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3519  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1303  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.539571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1133  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3223  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.808026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0642  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0211837  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2233  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.28 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0532084  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.96 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2168  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000216085  hitchhiker  0.000000791345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2783  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.448465 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2945  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0214654  normal  0.391037 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3027  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3124  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.473866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7409  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.394693  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  37.96 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1168  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.474784  normal  0.334361 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3314  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.431384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  42.59 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2387  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.344208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2900  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0642579  normal  0.0916709 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  37.04 
 
 		 112 aa  75.5  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  42.99 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1071  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002766  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2559  nitrogen regulatory protein P-II  40.37 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32282  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2879  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1069  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.607168  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3586  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0323305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4580  nitrogen regulatory protein P-II  39.45 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.495708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2361  nitrogen regulatory protein P-II  42.86 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1613  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03218  hypothetical protein  40.95 
 
 		 114 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1355  nitrogen regulatory protein p-II  40.38 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2408  nitrogen regulatory protein P-II  40.95 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.82113  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0681  nitrogen regulatory protein P-II  41.12 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.4321 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2550  nitrogen regulatory protein P-II  38.1 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0188103  normal  0.0743791 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1831  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 114 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0808  nitrogen regulatory protein P-II  40.74 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0899844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  39.42 
 
 		 110 aa  73.9  0.0000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6587  nitrogen regulatory protein P-II  39.81 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.490351 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2711  nitrogen regulatory protein P-II  39.05 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000634529  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1061  nitrogen regulatory protein P-II  43.12 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.102544  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  41.9 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2376  nitrogen regulatory protein PII  40.37 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0285666  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  38.53 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>