More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1554 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1554  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
125 aa  248  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2279  P-II family nitrogen regulatory protein  55.65 
 
 
123 aa  141  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000418064  normal  0.159182 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0063  nitrogen regulatory protein P-II  53.6 
 
 
121 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0145  nitrogen regulatory protein P-II  51.2 
 
 
120 aa  131  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.550451  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0100  nitrogen regulatory protein P-II  52 
 
 
121 aa  126  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.250689  normal  0.0316533 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0660  nitrogen regulatory protein P-II  51.2 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1801  nitrogen regulatory protein P-II  50.81 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1432  nitrogen regulatory protein P-II  49.21 
 
 
128 aa  114  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1048  nitrogen regulatory protein P-II  42.42 
 
 
127 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1025  nitrogen regulatory protein P-II  53.12 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0550  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  48.04 
 
 
114 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0094622  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0169  nitrogen regulatory protein P-II  44.63 
 
 
125 aa  103  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00936567  normal  0.629139 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2819  nitrogen regulatory protein P-II  46.09 
 
 
126 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2615  nitrogen regulatory protein P-II  40.48 
 
 
124 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0559  nitrogen regulatory protein P-II  42.45 
 
 
139 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000146576  normal  0.195853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1629  nitrogen regulatory protein P-II  45.04 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000227966  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1753  nitrogen regulatory protein P-II  45.8 
 
 
125 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.424498  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0953  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0132  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  87  7e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000199717  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0742  nitrogen regulatory protein P-II  44.62 
 
 
125 aa  87  7e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1246  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.62 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000500613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1124  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0770383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1695  nitrogen regulatory protein P-II  41.41 
 
 
112 aa  85.9  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.596367 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_942  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0436  nitrogen regulatory protein P-II  37.93 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.447184  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1530  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  43.85 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.858615  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1065  nitrogen regulatory protein P-II  38.28 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3092  nitrogen regulatory protein P-II  39.23 
 
 
131 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0683  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1156  nitrogen regulatory protein P-II  38.4 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1481  nitrogen regulatory protein P-II  41.13 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.19711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0014  nitrogen regulatory protein P-II  38.28 
 
 
112 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0394648 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1466  nitrogen regulatory protein P-II  37.8 
 
 
113 aa  81.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.629362 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0193  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4397  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.467345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0141  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
111 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457658  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0715  nitrogen regulatory protein P-II  41.13 
 
 
112 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000630678  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1017  nitrogen regulatory protein P-II  40 
 
 
126 aa  81.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301084  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1017  nitrogen regulatory protein P-II  39.84 
 
 
113 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000487669  normal  0.288979 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1951  nitrogen regulatory protein P-II  42.31 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122455  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0556  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  41.94 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4813  nitrogen regulatory protein P-II  36.72 
 
 
112 aa  80.5  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.311514  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0158  nitrogen regulatory protein P-II  40.83 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.828018  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2310  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.29 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0255165  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  80.1  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_004310  BR1005  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1144  nitrogen regulatory protein P-II  39.26 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.931676  normal  0.946017 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0971  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.650891  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2088  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1351  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000771293  hitchhiker  0.0000000000923382 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4248  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.415508  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0846  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1640  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
123 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.563985  normal  0.465051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0836  nitrogen regulatory protein P-II  36 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2861  nitrogen regulatory protein P-II  36.72 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.715878  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  35.94 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1888  nitrogen regulatory protein P-II  35.71 
 
 
112 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4874  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3267  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1836  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0337137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1345  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.934318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1331  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.311288  normal  0.632434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2899  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0172484 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0650  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.367034  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1086  nitrogen regulatory protein P-II  40.32 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0969  nitrogen regulatory protein P-II  38.28 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0429  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.398049  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2237  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.694402  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3649  nitrogen regulatory protein P-II 1  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0591  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307832  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2767  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1063  nitrogen regulatory protein P-II  39.06 
 
 
112 aa  77  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.403176  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2330  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.678822  normal  0.202545 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1063  nitrogen regulatory protein P-II  37.5 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.710847  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0935  nitrogen regulatory protein P-II  35.94 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000154174  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1339  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  37.3 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1188  nitrogen regulatory protein P-II  35.48 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671677  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0623  nitrogen regulatory protein P-II  37.1 
 
 
112 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000846933  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  36.29 
 
 
112 aa  77  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2505  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  41.53 
 
 
110 aa  76.6  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4404  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.795902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4381  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
117 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.647425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2479  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
112 aa  76.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.494885  normal  0.880519 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3119  nitrogen regulatory protein P-II  38.71 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0878953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1516  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.14536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5130  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.179689  normal  0.884639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2651  nitrogen regulatory protein P-II  39.52 
 
 
112 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.614169  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0135  nitrogen regulatory protein P-II  37.9 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000114835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>