103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1510 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1510  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  322  1e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.285079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1794  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  50.69 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1791  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  35.14 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D31  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.575009  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0340  UspA family nucleotide-binding protein  30.87 
 
 		 155 aa  87  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000238748  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1677  hypothetical protein  26.9 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0048801  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  28.86 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1231  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  30 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0928925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  27.59 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  29.17 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  28.47 
 
 		 166 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  30.57 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  30.72 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  25.83 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4760  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4523  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4359  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4875  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4754  universal stress protein family  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00141211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4733  universal stress protein family  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0502  universal stress protein family  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4743  universal stress protein family  25 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  27.81 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3301  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4370  universal stress protein  25 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1601  hypothetical protein  25.34 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.239792  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4455  UspA domain-containing protein  24.32 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0391704  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1912  UspA domain protein  34.44 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1848  UspA family nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0486  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000206197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  29.66 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2541  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  25.68 
 
 		 145 aa  51.2  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1678  UspA domain-containing protein  29.3 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.222334  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 141 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1290  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.466439  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0309  hypothetical protein  28.19 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  28.48 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4695  hypothetical protein  23.6 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1646  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.9 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  31.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  31.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  31.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  31.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  31.76 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  27.39 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  28.67 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  27.74 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1769  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00594463  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  27.74 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  28.39 
 
 		 288 aa  47  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4785  UspA domain protein  21.94 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3008  UspA domain protein  27.85 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.396305 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0071  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  27.5 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000663876  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1284  UspA family nucleotide-binding protein  26.14 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.176075  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4368  UspA domain protein  25.15 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.2229 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  27.27 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  27.03 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  26.75 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  26.75 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  26.53 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  31.08 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  30.41 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  30.34 
 
 		 317 aa  44.7  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3549  UspA domain protein  30 
 
 		 278 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1327  hypothetical protein  25.68 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0271  UspA domain-containing protein  28.95 
 
 		 250 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00141886  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  44.3  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1742  UspA domain-containing protein  30.28 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0436973  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1017  UspA domain-containing protein  26.53 
 
 		 138 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0550941 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  29.05 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  26.49 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0292  UspA domain protein  29.68 
 
 		 303 aa  44.3  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 293 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5095  UspA domain protein  22.84 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4260  UspA domain protein  27.33 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290835  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  27.04 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0128  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  24.83 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319103  hitchhiker  0.0000000012302 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0816  UspA family nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000142801  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1131  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 138 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.922965  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  26.76 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.14 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.07 
 
 		 151 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  26.17 
 
 		 144 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  29.53 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  27.15 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0519  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0804  UspA domain protein  30.34 
 
 		 138 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.380791 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  30.28 
 
 		 305 aa  42  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.94 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  28 
 
 		 155 aa  41.2  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1169  UspA family nucleotide-binding protein  29.14 
 
 		 142 aa  41.2  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0164602  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  22.6 
 
 		 291 aa  41.2  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1733  universal stress protein  22.97 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  27.33 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>