More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  48.4 
 
 
688 aa  636    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  49.1 
 
 
703 aa  643    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  100 
 
 
726 aa  1455    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  48.4 
 
 
695 aa  630  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  48.35 
 
 
698 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  47.94 
 
 
698 aa  612  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  46.87 
 
 
690 aa  613  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  46.15 
 
 
706 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  46.15 
 
 
706 aa  592  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  46.15 
 
 
706 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  44.43 
 
 
719 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  45.49 
 
 
712 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  43.59 
 
 
744 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  45.42 
 
 
726 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  46.29 
 
 
748 aa  577  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  44.72 
 
 
739 aa  572  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  43.57 
 
 
709 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  44.94 
 
 
706 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  45.26 
 
 
696 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  39.8 
 
 
688 aa  543  1e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  42.3 
 
 
680 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  40.97 
 
 
685 aa  492  1e-137  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  39.97 
 
 
682 aa  489  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.63 
 
 
680 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.05 
 
 
680 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  36.57 
 
 
721 aa  479  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  37.01 
 
 
705 aa  480  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.92 
 
 
680 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  36.81 
 
 
671 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  39.3 
 
 
686 aa  473  1e-132  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.81 
 
 
686 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  40.22 
 
 
696 aa  469  1.0000000000000001e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  35.2 
 
 
838 aa  468  9.999999999999999e-131  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  40.03 
 
 
685 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  35.81 
 
 
697 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  36.54 
 
 
686 aa  462  1e-129  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  37.87 
 
 
691 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.19 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  39.72 
 
 
678 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.28 
 
 
683 aa  456  1e-127  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  39.94 
 
 
684 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  33.94 
 
 
686 aa  453  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  38.41 
 
 
697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  40.5 
 
 
682 aa  451  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  33.25 
 
 
818 aa  451  1e-125  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  37.1 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  37.1 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  37.34 
 
 
677 aa  449  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  37.8 
 
 
710 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  37.1 
 
 
683 aa  450  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  36.7 
 
 
699 aa  451  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  36.83 
 
 
715 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  35.56 
 
 
700 aa  445  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  39.28 
 
 
696 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  37.74 
 
 
678 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  38.65 
 
 
713 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  34.86 
 
 
696 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  32.78 
 
 
711 aa  436  1e-121  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  37.73 
 
 
690 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  34.3 
 
 
704 aa  435  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  37.36 
 
 
678 aa  436  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  35 
 
 
696 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  37.45 
 
 
686 aa  431  1e-119  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  35.11 
 
 
701 aa  431  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  36.78 
 
 
683 aa  427  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  36.92 
 
 
683 aa  428  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  35.1 
 
 
709 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  36.21 
 
 
701 aa  425  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  35.01 
 
 
729 aa  423  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  36.11 
 
 
698 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  33.79 
 
 
725 aa  419  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  34.82 
 
 
708 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  38.67 
 
 
714 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  36.94 
 
 
739 aa  420  1e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  35.08 
 
 
700 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  36.07 
 
 
717 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  35.8 
 
 
697 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  36.12 
 
 
683 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  38.05 
 
 
711 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  34.16 
 
 
722 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  34.94 
 
 
711 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  34.59 
 
 
702 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  34.67 
 
 
711 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  34.93 
 
 
756 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  34.81 
 
 
711 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  34.67 
 
 
711 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  33.83 
 
 
701 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  36.66 
 
 
717 aa  412  1e-113  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  35.49 
 
 
703 aa  410  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  36.55 
 
 
695 aa  410  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  35.06 
 
 
710 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  34.31 
 
 
702 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  34.73 
 
 
711 aa  409  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  34.03 
 
 
702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  33.56 
 
 
702 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  36.26 
 
 
715 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  35.39 
 
 
695 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  33.56 
 
 
702 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  33.56 
 
 
697 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  34.56 
 
 
711 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>