More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2766 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0568  protease II  51.09 
 
 
702 aa  694    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  49.93 
 
 
701 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  52.65 
 
 
715 aa  708    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  53.13 
 
 
695 aa  704    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  53.03 
 
 
698 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  54.28 
 
 
708 aa  725    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  53.02 
 
 
711 aa  696    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  51.86 
 
 
717 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  53.27 
 
 
713 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  52.94 
 
 
715 aa  697    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  52.69 
 
 
697 aa  704    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  49.19 
 
 
702 aa  651    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  51.87 
 
 
700 aa  712    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  59.12 
 
 
695 aa  806    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  49.19 
 
 
702 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  49.78 
 
 
702 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  49.71 
 
 
710 aa  641    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  49.93 
 
 
756 aa  683    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  52.59 
 
 
703 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  48.56 
 
 
709 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  51.09 
 
 
702 aa  694    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  53.8 
 
 
714 aa  704    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  52.73 
 
 
705 aa  703    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  59.97 
 
 
701 aa  844    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  100 
 
 
696 aa  1393    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  52.03 
 
 
696 aa  685    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  53.61 
 
 
714 aa  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  52.75 
 
 
699 aa  707    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  50.29 
 
 
701 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  51.97 
 
 
713 aa  695    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  44.61 
 
 
696 aa  611  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  46.96 
 
 
710 aa  567  1e-160  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  42.57 
 
 
697 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  38.89 
 
 
721 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  42.01 
 
 
682 aa  511  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.6 
 
 
705 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  39.48 
 
 
688 aa  497  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  40.49 
 
 
715 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  40.97 
 
 
686 aa  489  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  40.78 
 
 
691 aa  491  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  37.28 
 
 
686 aa  488  1e-136  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  39.44 
 
 
671 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  38.06 
 
 
686 aa  480  1e-134  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  38.65 
 
 
697 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  40.09 
 
 
710 aa  478  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  39.02 
 
 
685 aa  477  1e-133  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  36.93 
 
 
711 aa  472  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  37.81 
 
 
725 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  40.14 
 
 
683 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  40.37 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  40.48 
 
 
680 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  38.48 
 
 
700 aa  458  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  40.8 
 
 
680 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  39.46 
 
 
690 aa  456  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  39.91 
 
 
678 aa  457  1e-127  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.88 
 
 
686 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  39.38 
 
 
698 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  39.68 
 
 
678 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  39.91 
 
 
680 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  39.24 
 
 
698 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  40.17 
 
 
682 aa  454  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  37.63 
 
 
683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  37.63 
 
 
683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  37.63 
 
 
683 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  40.8 
 
 
680 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  40.11 
 
 
695 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  40.5 
 
 
684 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  37.91 
 
 
711 aa  451  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  38.05 
 
 
711 aa  450  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  37.88 
 
 
711 aa  451  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  39.2 
 
 
688 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  37.7 
 
 
677 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  39.26 
 
 
686 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  38.3 
 
 
678 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  39.44 
 
 
703 aa  442  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  36.32 
 
 
696 aa  445  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  36.03 
 
 
696 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  37.59 
 
 
739 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  38.06 
 
 
711 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  36.26 
 
 
722 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  35.68 
 
 
704 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  36.8 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  37.7 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  36.8 
 
 
711 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  36.95 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  36.95 
 
 
711 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  37.66 
 
 
683 aa  437  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  39.17 
 
 
685 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  40.06 
 
 
706 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  37.13 
 
 
717 aa  431  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  37.76 
 
 
726 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  40.06 
 
 
706 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  40.06 
 
 
706 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  34.21 
 
 
719 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  39.42 
 
 
726 aa  425  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  38.38 
 
 
686 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  35.27 
 
 
685 aa  419  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  37.6 
 
 
782 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  38.95 
 
 
719 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  34.99 
 
 
729 aa  415  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>