More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0844 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  58.8 
 
 		 702 aa  835    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  61.07 
 
 		 702 aa  865    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  55.83 
 
 		 701 aa  807    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  58.11 
 
 		 705 aa  816    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2471  peptidase S9, prolyl oligopeptidase  57.55 
 
 		 695 aa  820    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.511382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3297  Oligopeptidase B  51.46 
 
 		 695 aa  697    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.501121  normal  0.104616 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  58.53 
 
 		 709 aa  837    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  60.29 
 
 		 698 aa  848    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  60.63 
 
 		 701 aa  860    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  59.63 
 
 		 708 aa  839    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  54.03 
 
 		 701 aa  768    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  58.93 
 
 		 717 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  60.81 
 
 		 703 aa  835    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  52.79 
 
 		 696 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  52.86 
 
 		 710 aa  739    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  58.61 
 
 		 713 aa  821    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  59.65 
 
 		 715 aa  820    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  57.61 
 
 		 697 aa  821    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  59.51 
 
 		 715 aa  833    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  100 
 
 		 699 aa  1432    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  60.52 
 
 		 700 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  59.94 
 
 		 711 aa  821    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1577  oligopeptidase B  49.93 
 
 		 710 aa  641    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  53.39 
 
 		 756 aa  758    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  58.8 
 
 		 702 aa  832    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  59.24 
 
 		 714 aa  806    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  60.93 
 
 		 702 aa  863    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  52.24 
 
 		 696 aa  747    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  61.11 
 
 		 702 aa  862    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  56.67 
 
 		 696 aa  778    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  60.06 
 
 		 714 aa  819    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  58.27 
 
 		 713 aa  814    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  44.94 
 
 		 688 aa  617  1e-175  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  44.82 
 
 		 721 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  44.59 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1423  oligopeptidase B  47.76 
 
 		 697 aa  610  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0258557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  45.93 
 
 		 671 aa  608  9.999999999999999e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  47.29 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  47.75 
 
 		 698 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  44.48 
 
 		 686 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  44.31 
 
 		 711 aa  595  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  47.37 
 
 		 695 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  48.63 
 
 		 688 aa  591  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  47.26 
 
 		 698 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  45.32 
 
 		 686 aa  581  1e-164  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2995  oligopeptidase B  45.93 
 
 		 715 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0563376 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  45.81 
 
 		 678 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  45.83 
 
 		 710 aa  575  1.0000000000000001e-163  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.93 
 
 		 682 aa  558  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  45.36 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  44.28 
 
 		 685 aa  552  1e-155  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  45.05 
 
 		 690 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  42.5 
 
 		 726 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  44.66 
 
 		 712 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  43.94 
 
 		 719 aa  538  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0821  oligopeptidase B  43.52 
 
 		 717 aa  535  1e-151  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.35 
 
 		 697 aa  538  1e-151  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  44.63 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0732  oligopeptidase B  42.72 
 
 		 739 aa  537  1e-151  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.425538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  44.63 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  43.82 
 
 		 706 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  44.49 
 
 		 706 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  43.5 
 
 		 678 aa  533  1e-150  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.69 
 
 		 683 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.69 
 
 		 683 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.69 
 
 		 683 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  40.9 
 
 		 696 aa  526  1e-148  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  40.69 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  40.06 
 
 		 725 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  42.94 
 
 		 709 aa  525  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  41.38 
 
 		 677 aa  525  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  39.42 
 
 		 719 aa  518  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  40.98 
 
 		 683 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.07 
 
 		 711 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.32 
 
 		 697 aa  512  1e-144  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  40.84 
 
 		 686 aa  511  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  40.32 
 
 		 683 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  43.18 
 
 		 696 aa  502  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  41.4 
 
 		 685 aa  504  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  40.37 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 711 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  40.4 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  41.24 
 
 		 680 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  40.09 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  39.66 
 
 		 711 aa  492  1e-137  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  39.51 
 
 		 711 aa  489  1e-137  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  39.22 
 
 		 729 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  39.66 
 
 		 711 aa  491  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  39.37 
 
 		 700 aa  488  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  41.18 
 
 		 680 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  41.1 
 
 		 680 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  38.87 
 
 		 683 aa  488  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  39.68 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  40.3 
 
 		 739 aa  483  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  39.68 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  41.27 
 
 		 703 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  39.54 
 
 		 686 aa  479  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  39.4 
 
 		 686 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>