More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0841 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  56.47 
 
 		 695 aa  763    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  56.7 
 
 		 696 aa  793    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  59.89 
 
 		 688 aa  819    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  61.48 
 
 		 719 aa  874    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  54.87 
 
 		 690 aa  764    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3040  Oligopeptidase B  47.47 
 
 		 744 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.873709 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  61.26 
 
 		 706 aa  870    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0109  Oligopeptidase B  50.46 
 
 		 782 aa  698    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3230  oligopeptidase B  47.64 
 
 		 739 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.128986  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  100 
 
 		 709 aa  1447    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  55.24 
 
 		 698 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  54.39 
 
 		 726 aa  756    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  61.26 
 
 		 706 aa  870    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  59.46 
 
 		 712 aa  856    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  50.63 
 
 		 703 aa  649    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  61.12 
 
 		 706 aa  869    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  59.52 
 
 		 706 aa  847    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  54.8 
 
 		 698 aa  740    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0982  protease II  41.4 
 
 		 838 aa  599  1e-170  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17850  oligopeptidase B  44.32 
 
 		 748 aa  587  1e-166  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.652383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  43.56 
 
 		 688 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.86 
 
 		 682 aa  571  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  43.64 
 
 		 685 aa  572  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0302  peptidase, S9A/B/C familie, catalytic domain protein  38.33 
 
 		 818 aa  567  1e-160  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.327018 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  41.61 
 
 		 711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  45.49 
 
 		 686 aa  560  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  44.32 
 
 		 680 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  42.32 
 
 		 705 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  42.67 
 
 		 686 aa  559  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  44.19 
 
 		 680 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  41.05 
 
 		 686 aa  558  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  44.05 
 
 		 680 aa  555  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  44.19 
 
 		 680 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  43.91 
 
 		 685 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  43.06 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.54 
 
 		 721 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16430  protease II  43.57 
 
 		 726 aa  539  9.999999999999999e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.33763  normal  0.0433895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  41.12 
 
 		 671 aa  541  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  43.22 
 
 		 682 aa  536  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  42.55 
 
 		 684 aa  532  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  42.49 
 
 		 678 aa  535  1e-150  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  42.24 
 
 		 683 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  42.94 
 
 		 699 aa  525  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  41.9 
 
 		 698 aa  522  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  41.84 
 
 		 683 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  43.7 
 
 		 710 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  40.23 
 
 		 697 aa  509  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1258  protease II  41.31 
 
 		 709 aa  502  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125554  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  40.67 
 
 		 700 aa  505  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4953  oligopeptidase B  41.62 
 
 		 711 aa  501  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000190534 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1332  oligopeptidase B  41.31 
 
 		 717 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4444  oligopeptidase B  42.2 
 
 		 714 aa  499  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.85363 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  41.35 
 
 		 696 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  40.62 
 
 		 677 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  41.84 
 
 		 678 aa  496  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 683 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 683 aa  496  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  40.79 
 
 		 701 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  41.69 
 
 		 713 aa  497  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.37 
 
 		 683 aa  496  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0431  oligopeptidase B  41.36 
 
 		 715 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  40.34 
 
 		 683 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  39.63 
 
 		 683 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  42.01 
 
 		 703 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  40.31 
 
 		 678 aa  493  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  39.92 
 
 		 702 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  39.92 
 
 		 702 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0542  peptidase S9A family  40.81 
 
 		 703 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  40.67 
 
 		 697 aa  492  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0502  Oligopeptidase B  41.76 
 
 		 714 aa  491  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0140274  normal  0.0418806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0465  Oligopeptidase B  41.64 
 
 		 715 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.770478  normal  0.200287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0599  oligopeptidase B  40.2 
 
 		 702 aa  488  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.03 
 
 		 696 aa  487  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  40.56 
 
 		 690 aa  488  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1758  Oligopeptidase B  40.14 
 
 		 705 aa  487  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0951116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3959  oligopeptidase B  39.33 
 
 		 708 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  38.12 
 
 		 696 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  39.27 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  40.28 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  39.2 
 
 		 683 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.14 
 
 		 701 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  40.37 
 
 		 701 aa  480  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  37.36 
 
 		 719 aa  475  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0437  oligopeptidase B  39.04 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.365567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  39.86 
 
 		 702 aa  473  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  38.55 
 
 		 691 aa  474  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  39.28 
 
 		 711 aa  474  1e-132  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  38.72 
 
 		 700 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3717  oligopeptidase B  39 
 
 		 713 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2902  oligopeptidase B  39.41 
 
 		 697 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  38.97 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0421  peptidase, S9A/B/C family protein  37.71 
 
 		 696 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0147538  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  39.66 
 
 		 711 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  38.67 
 
 		 722 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  39.66 
 
 		 711 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  39.53 
 
 		 711 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  38.97 
 
 		 711 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  39.08 
 
 		 711 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  38.43 
 
 		 686 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.66 
 
 		 711 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>