More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1781 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  73.93 
 
 		 680 aa  1010    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3911  protease II  74.45 
 
 		 685 aa  1045    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.715631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1574  oligopeptidase B  74.3 
 
 		 686 aa  1047    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0149032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  73.75 
 
 		 684 aa  1033    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  79.32 
 
 		 683 aa  1103    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  100 
 
 		 678 aa  1384    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32900  Oligopeptidase B protein  75.66 
 
 		 682 aa  1028    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1306  oligopeptidase B  74.07 
 
 		 680 aa  1010    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  78.58 
 
 		 683 aa  1096    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3890  oligopeptidase B  73.33 
 
 		 680 aa  1015    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4105  oligopeptidase B  73.78 
 
 		 680 aa  1015    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0029  Oligopeptidase B  45.93 
 
 		 685 aa  572  1e-161  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  43.71 
 
 		 688 aa  568  1e-160  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2641  oligopeptidase B  44.49 
 
 		 686 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1392  Oligopeptidase B  41.47 
 
 		 686 aa  539  9.999999999999999e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  44.64 
 
 		 682 aa  537  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1376  oligopeptidase B  45.75 
 
 		 696 aa  536  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.175482  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4942  oligopeptidase B  45.99 
 
 		 706 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.14279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0841  Oligopeptidase B  42.49 
 
 		 709 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4559  oligopeptidase B  45.7 
 
 		 706 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4647  oligopeptidase B  45.7 
 
 		 706 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  40.96 
 
 		 721 aa  526  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10796  protease II ptrBb (oligopeptidase B)  43.53 
 
 		 719 aa  526  1e-148  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2556  oligopeptidase B  39.1 
 
 		 686 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3621  Oligopeptidase B  44.35 
 
 		 696 aa  526  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2979  oligopeptidase B  43.9 
 
 		 726 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0273053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1617  oligopeptidase B  43.37 
 
 		 706 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1937  oligopeptidase B  41.79 
 
 		 677 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.158885  normal  0.0155167 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1835  Oligopeptidase B  43.56 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94599  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2346  protease II  40.85 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.172701  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2442  oligopeptidase B  40.85 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.429738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1629  oligopeptidase B  40.85 
 
 		 683 aa  513  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  40.65 
 
 		 705 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  39.71 
 
 		 697 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3322  oligopeptidase B  42.98 
 
 		 688 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.166929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5137  oligopeptidase B  41.95 
 
 		 712 aa  511  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0551  Oligopeptidase B  43.5 
 
 		 678 aa  507  9.999999999999999e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  39.83 
 
 		 704 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4105  oligopeptidase B  43.4 
 
 		 698 aa  504  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4526  oligopeptidase B  43.3 
 
 		 698 aa  500  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835874 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2129  Oligopeptidase B  42.75 
 
 		 686 aa  499  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2119  Oligopeptidase B  43.09 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3467  oligopeptidase B  41.46 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3479  Oligopeptidase B  41.3 
 
 		 710 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.607992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8948  Oligopeptidase B  43.27 
 
 		 695 aa  497  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08101  Peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  38.9 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  39.18 
 
 		 671 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2416  protease 2  40.64 
 
 		 691 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0144  oligopeptidase B  41.78 
 
 		 703 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  38.78 
 
 		 696 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  38.49 
 
 		 696 aa  491  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2241  Oligopeptidase B  41.31 
 
 		 683 aa  491  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0633  oligopeptidase B  39.7 
 
 		 697 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1787  protease 2  40.3 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4763  oligopeptidase B  39.73 
 
 		 722 aa  487  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000033287 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2073  protease 2  40.3 
 
 		 686 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1936  protease 2  40.3 
 
 		 686 aa  488  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01816  protease II  40.15 
 
 		 686 aa  485  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4371  oligopeptidase B  40.03 
 
 		 729 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2579  protease 2  40 
 
 		 686 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.639161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01804  hypothetical protein  40.15 
 
 		 686 aa  485  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1343  protease 2  40.15 
 
 		 686 aa  484  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.790431  normal  0.26509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1051  Oligopeptidase B  41.67 
 
 		 690 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.552251  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1797  Oligopeptidase B  40 
 
 		 686 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2093  protease 2  40.6 
 
 		 683 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.559794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1370  protease 2  40.6 
 
 		 683 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364308  hitchhiker  0.00000000160982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2038  protease 2  40.45 
 
 		 683 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387089  normal  0.101545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2033  protease 2  40.6 
 
 		 683 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.147358  normal  0.976007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1245  protease 2  40.6 
 
 		 683 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0836  Oligopeptidase B  40.77 
 
 		 690 aa  473  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2691  oligopeptidase B  39.59 
 
 		 701 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04127  protease II  39.54 
 
 		 678 aa  466  9.999999999999999e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0862  oligopeptidase B  39.24 
 
 		 700 aa  469  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2839  oligopeptidase B  39.3 
 
 		 698 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.586529 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01150  Protease II  37.14 
 
 		 725 aa  462  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.545726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1343  oligopeptidase B  38.91 
 
 		 701 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  39.5 
 
 		 699 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2140  protease II  37.13 
 
 		 685 aa  461  9.999999999999999e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4644  protease II  37.63 
 
 		 719 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.624793  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  38.89 
 
 		 702 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0144  protease II  39.63 
 
 		 700 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0139  Oligopeptidase B  39.79 
 
 		 711 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0132  oligopeptidase B  39.94 
 
 		 716 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  38.89 
 
 		 702 aa  461  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4218  oligopeptidase B  39.65 
 
 		 711 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0987  Oligopeptidase B  37.48 
 
 		 702 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0136  oligopeptidase B  38.91 
 
 		 711 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0268176 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0130  oligopeptidase B  39.74 
 
 		 711 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1674  Oligopeptidase B  38.61 
 
 		 710 aa  456  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0871662 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0140  oligopeptidase B  39.65 
 
 		 711 aa  459  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0135  oligopeptidase B  38.94 
 
 		 711 aa  458  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231322 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2766  oligopeptidase B  39.91 
 
 		 696 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.34607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0135  oligopeptidase B  39.5 
 
 		 711 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0860  Oligopeptidase B  37.19 
 
 		 702 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.142152  normal  0.357282 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1644  oligopeptidase B  38.65 
 
 		 701 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.378533  normal  0.307491 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0135  oligopeptidase B  39.26 
 
 		 711 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0878  oligopeptidase B  38.12 
 
 		 756 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.880686 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0039  oligopeptidase B  40.4 
 
 		 686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4179  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  40.32 
 
 		 713 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.210389  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_24161  predicted protein  38.45 
 
 		 812 aa  449  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.314931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>